Igra otkriva sam početak Lare Croft i njeno sazrevanje od uplašene devojke do snažne i čvrste osobe koja zna kako preživeti. Priča započinje na brodu Endurance kojeg usred Tihog oceana pogađa silovita oluja i prepolovljuje ga u dva dela. Lara, zajedno s ostalim putnicima, preživi zahvaljujući izolovanom tropskom ostrvu koje se nalazi u blizini nesretnog događaja. Kako bi preživela, Lara mora krenuti u potragu za hranom i ostalim putnicima na ostrvu u gde divlje životinje predstavljaju opasnot. No, ostrvo skriva veću opasnot od samih životinja, grupu zlonamernih plaćenika koji žele ubiti Laru i sve preživele putnike...